《吕祖全书》六十四卷，属于道教吕派“道藏”。
此《吕祖全书》由清代刘体恕汇辑作三十二卷，后由邵志琳增辑为六十四卷。汇辑有关吕洞宾之事迹、神话传说及著作，反映吕洞宾道教思想的专题丛书。此为清乾隆四十年武林王履阶刊本，是清代南方地区对于吕洞宾思想与信仰的一种文化体现。
吕洞宾道号纯阳子，名碞，约生活在唐末五代。《宋史》的陈抟传中提到陈与异人吕碞往来。这是所谓正史上第一次提到他。从道教内部的各种资料分析，他的师父是锺离权，号正阳子，师徒授受，有《锺吕传道集》为记。以後此一道脉於宋代和金代大放异彩。
多数人认为，金丹南宗和北宗即全真道都接续了他的真传。所以全真派将他当成五祖之一。元代全真道受到朝庭的重视，吕碞也被尊为帝君。吕洞宾思想历代有几次结集，至于清代末年已至大成，然还有大量经典流落民间未曾收录。后李涵虚开西派所辑全书，于丹道而言则至精粹，别成系统。吕洞宾在道教以至中华文化史上都有其尊崇地位。
从吕祖信仰本身来说，则是因为对他的崇拜实际上已经形成了完整的体系。
其中包括：吕祖神庙或神殿，它们是崇拜的大本营；吕祖神像，其中小型的可以让人请回家中供奉，一般在岭南地区流传的像比较瘦削，北方地区的比较丰腴，这是随人所思而形成的不同风格的绘像；与吕祖有关的书籍，其中被认为是吕祖所作的部分，被后人编成《吕祖全书》，此外尚有象《吕祖宝忏》一类志存劝善的小册子；扶乩、灵签和祈梦等民间常行的占问吉凶祸福的方法。
吕祖全书本传小序
吕祖对正阳帝君「欲度尽众生，方肯上升」，迨上升之后，复行化度世，是以由唐迄今，隐显变化不一，世称吕仙，其自称曰回道人，曰无上宫主，究证位无上圣师，灵迹极多，不能尽载。
本传止据原传叙次，间有增入，并分注处，以备参考。至传闻之异，有谓本唐宗室姓李，或曰名，或曰名琼，以夫妇入山双修，易姓吕；或曰举进士第作令，或曰举进士不第；或曰六十四岁游长安，遇正阳帝君，或曰六十四岁上朝元始玉皇；或曰四月十四日生，或曰八月初四日生；其生之年，或曰贞观，或曰天宝，或曰贞元，种种不一。吕祖尝曰：「呼牛应牛，呼马应马，世人之谬，乃真乃假，吾唐以前，吾亦何有也」其言达矣！
夫太上降生，指李为氏，雪山初诞，从而出，以及二龙绕室，五星在庭，神灵之征，历历不爽。仙佛圣贤之生，由来异矣。若吕祖吾又乌能测之哉。
卷一：吕祖本传
卷二：灵应事迹
卷三：忠诰
卷四：孝诰
卷五：前八品仙经上
卷六：前八品仙经下
卷七：后八品仙经
卷八：五品经
卷九：清微三品经上
卷十：清微三品经中
卷十一：清微三品经下
卷十二：参同经上
卷十三：参同经中
卷十四：参同经下
卷十五：圣德诸品经上
卷十六：圣德诸品经下
卷十七：醒心经
卷十八：广慧超劫经
卷十九：延生证圣真经
卷二十：先天一气度人妙经
卷二十一：孚佑帝君心经
卷二十二：金丹示掌初编
卷二十三：三宝新镫上
卷二十四：三宝新镫下
卷二十五：训世文
卷二十六：金刚经注释上
卷二十七：金刚经注释下
卷二十八：玉枢宝经赞附或问
卷二十九：灵宝毕法小乘
卷三十：灵宝毕法中乘
卷三十一：灵宝毕法大乘
卷三十二：修真传道集上
卷三十三：修真传道集下
卷三十四：文集上
卷三十五：文集中
卷三十六：文集下
卷三十七：葫头集上
卷三十八：葫头集下
卷三十九：涵三杂咏
卷四十：涵三语录
卷四十一：指玄篇
卷四十二：浑成篇
卷四十三：名坛新咏
卷四十四：语录会粹
卷四十五：福报指南
卷四十六：儒道同源
卷四十七：群言会粹
卷四十八：药石制
卷四十九：太乙金华宗旨
卷五十：金丹种子篇
卷五十一：警世功过格
卷五十二：十戒十行
卷五十三：度厄救劫救苦涤氛四神咒
卷五十四：雪过修真仙忏
卷五十五：敲爻歌沁园春百字碑注解
卷五十六：广化真经
卷五十七：治病仙方决疑签诗
卷五十八：金丹救劫度人宝忏
卷五十九：慈航无极宝忏
卷六十：证道成真心忏
卷六十一：禅宗正指上
卷六十二：禅宗正指中
卷六十三：禅宗正指下
卷六十四：吕祖诰